La présence d'eau dans le carburant diesel peut endommager gravement les moteurs diesel si elle n'est pas éliminée. Les microbes ont besoin d'eau pour se développer. Même en petite quantité, l'eau peut favoriser la rouille et la corrosion, et contribuer à la formation de boues susceptibles d'obstruer les injecteurs, les filtres et de nuire aux performances du moteur. Le carburant absorbe son propre volume d'eau.